Fèm ou nan Farmers Versus Aliens anba menas grav nan espas eksteryè. Pou kèk rezon, etranje ki soti nan yon galaksi byen lwen deside kidnape bèt nan fèm ou a, e sa a se pa nan tout bon. Pa gen anyen ki ka eksplike pèt bèt vivan ki pral kwè ke etranje te vòlè bèf, mouton, kochon ak chwal. Ou pral oblije kache yo epi pou fè sa ou dwe ede kiltivatè a kondwi chak bèt nan yon zòn vèt triyangilè kote bèt korespondan an trase. Sa a pral kache tout bèt vivan ou nan je etranje yo. Men, prese leve, otreman yo pral kòmanse Operation Farmers Versus Aliens.
