Migrasyon zwazo se migrasyon anyèl zwazo nan rejyon ki pi cho yo. Yon fwa otòn rive, anpil espès zwazo ale nan sid pou siviv sezon fredi a. Kanna yo se youn nan yo, ak nan jwèt la ou pral ede yon sèl kanna simonte yon vòl difisil. Men, anvan ou bezwen chwazi yon karaktè nan ewo yo prezante nan jwèt la: Pam, Mac, Tonton Dann, Gwen ak Dax. Nenpòt nan yo pral obeyi kontwòl ou. Konplo a nan Migrasyon Flappy Duck se ke zwazo ou te tonbe dèyè bann mouton an. Lè tout fanmi li yo te vole ale, zèl li te domaje, men kounye a li te geri epi ou ka eseye ratrape ak twoupo a epi vole ansanm. Men, anvan ou pral gen simonte yon anpil nan obstak ak bat zèl ou kouray san yon repo nan Migration Flappy Duck.
